חטיבת מבצעים הוקמה בשנת 1978 במטרה לנהל, לפתח ולהפעיל את מערך התעבורה האוירית האזרחית בישראל, זאת באמצעות שתי יחידות בקרה (צפון ודרום), חמישה מגדלי פיקוח (ראש-פינה, הרצליה, נתב"ג, אילת ועובדה) ושתי יחידות מודיעין-טיס (נתב"ג ואילת). החטיבה כוללת את יחידות המטה הבאות:
- לשכת הסמנכ"ל למבצעים, אחריות כוללת לניהול התעבורה האווירית באמצעות יחידת המטה והיחידות המבצעיות
- ממונה על תעבורה אוירית, אחראי ישירות על הפעלת יחידות פיקוח טיסה ובקרה ותכנון המרחב האוירי
- ממונה על תכנון ופיתוח מבצעי, אחראי על פיתוח מערכות, רכש ובקרה תקציבית
- ראש אגף מודיעין-טיס, אחראי על פיתוח תו"ל ונהלים בתחום מודיעין-טיס, מנחה מקצועית את היחידות בנתב"ג ובאילת, ואחראי על תיאום פעילות אווירית חריגה במרחב האווירי
- אחראי תקינה מבצעית, מרכז את הטיפול בהגבלות בניה סביב שדות תעופה, פיתוח שדות התעופה מההיבט המבצעי ותיאום תקינה מבצעית מול מינהל התעופה האזרחית
- מתכנן מערכות תעבורה אוירית, אחראי על תכנון נתיבי טיסה ומרחבי אויר בהם מתבצעת טיסת מכשירים, ותאימותם לתקנים הבינלאומיים
- פקח טיסה ראשי, אחראי על הנושאים המקצועיים בתחום פיקוח טיסה ובקרה, כולל מערך ההדרכה המבצעית בארץ ובחו"ל ושמירת רמה מקצועית נאותה