במסוף מתבצעים מספר סוגים של שינוע מטענים:

יבוא:

משטחים
מרבית הסחורה מגיעה למסוף על גבי משטחים ומטופלת על ידי מלגזות. על מנת להקל על תהליך הפריקה במסוף הישראלי, יש לוודא כי הסחורה מסודרת בצורה מתאימה על גבי המשטחים.

סחורה שלא תסודר בצורה מתאימה, תוחזר למסוף המצרי לטיפול נוסף.

אגרגטים
למסוף מגיעות סחורות בתפזורת כגון: מלט, שיש, וכיו"ב. הסחורה מאוחסנת במתקנים המיועדים לכך, עד להגעת משאית ישראלית להעמסתה.

מכולות
סחורה המגיעה בתוך מכולות כמו מכולת קירור וכדו', פורקת את מטענה באמצעות מלגזות ומועמסת על גבי משאית ישראלית מתאימה.

גב אל גב
סחורה הפורקת את מטענה ישירות ממשאית מצרית אל משאית ישראלית.

יצוא:

יצוא סחורות מתבצע על פי המתכונת הנ"ל,  במסוף המצרי.