המסוף ממוקם בפתחת ניצנה, סמוך לכפר הנוער ניצנה ולמושב ניצני סיני (קדש ברנע), בתחומי המועצה האזורית רמת נגב. 

צירי הגישה למסוף:

ממזרח:

כביש מס' 211 - מבאר שבע, דרך צומת טללים, קציעות ומושבי המועצה האזורית רמת נגב - 77 ק"מ.

מצפון מערב:

מצומת הכבישים כרם –שלום, דרך כביש המערכת -ציר פילדלפי- שמתחיל מהים בסמוך לרפיח - כ- 50 ק"מ.

הכביש צר ואינו מתאים לנסיעת כלים כבדים.

נסיעה על הכביש דורשת תיאום מוקדם עם שלטונות הצבא.

מדרום מזרח:

מכיוון אילת והר חריף, דרך ציר פילדלפי. 

הכביש צר והנסיעה עליו דורשת תיאום מוקדם.