המסוף משמש למעבר סחורות ומטענים מסוגים שונים ומגוונים, ביניהם:
- מוצרי מזון (בעיקר לתחומי הרשות הפלסטינית).
- כימיקלים.
- מוצרי נייר גולמי.
- מלט ומוצרי בנייה.
- גרעינים וזרעים.
- ירקות קפואים.
- דגים מצוננים.
- מוצרי טקסטיל.
- מוצרי ניילון.
- מוצרי חשמל.
- תבלינים.
- זכוכית.
סחורה אשר מגיעה מישראל, יוצאת עוד באותו יום למסוף המצרי, ומשם ליעדה במצרים ומחוצה לה.
סחורה אשר מגיעה ממצרים למסוף הישראלי, יוצאת ברוב הפעמים באותו יום, ליעדיה הסופיים בישראל או בשטחי הרשות.