במסוף נהר הירדן מתוכננות עבודות הפיתוח הבאות:
· הוספת 2 בורות בידוק לרכב פרטי בנוסף ל- 2 בורות קיימים.
· הרחבת שטחי עבודה במסוף המטענים.
· סלילת כביש גישה מערבי למסוף המטענים.
· שינוי צומת הכניסה למסוף הנוסעים.
· העתקת שער הכניסה הראשי למערב, סמוך למגרש החנייה.
· סלילת כביש כניסה, מהכביש המערבי למטענים אל מסוף הנוסעים.
· סלילת סובה לרכב פרטי המאפשר גישה למגרש החנייה או חזרה לבית שאן.
· בנית מבנה המתנה לנהגים ירדניים בכניסה למסוף המטענים.
· תכנון וביצוע שערי כניסה מוצלים למסוף – כולל רחבת ביקורת הגבולות ב "דרייב אין".
· הקמת תחנת משאבות וקו סניקת ביוב למערכת ביוב אזורית.
· הצבת מכשירי ביקורת גבולות ביומטרית באולמות הכניסה והיציאה.
· הכנסת שירות אחמי"ם לרווחת הנוסעים.
· תכנון והעברת משרדים ממבנים יבילים למבנה קבוע.
· העתקת חדר האוכל ויחידת צה"ל למבנה קבוע.