בערב יום כיפור, יום ראשון ה- 27.9.09, תיפסק התנועה האווירית האזרחית בישראל בשעה 13:00. במוצאי יום כיפור, יום שני 28.9.09, יפתח נמל התעופה בן גוריון לנחיתת טיסות בינלאומיות בשעה 21:30 ולהמראת טיסות בינלאומיות החל משעה 22:30. התנועה בנמל התעופה אילת ובשדות התעופה הפנים ארציים תתחדש בשעה 21:00.

ביום ראשון, ערב כיפור, צפויות בנתב"ג כ- 170 טיסות מתוכן 87 טיסות יוצאות ו-83 טיסות נכנסות עם תנועת נוסעים כוללת של כ- 26,000 נוסעים. ההמראה האחרונה מנתב"ג בערב כיפור תהיה של טיסת חברת אוסטריאן איירליינס שתצא לוינה בשעה 12:50.

בצאת יום כיפור, עת תתחדש תנועת המטוסים בנתב"ג, צפויות 21 נחיתות ו- 17 המראות. הנחיתה הבינלאומית הראשונה במוצאי יום כיפור תהיה של טיסת קונטיננטל בשעה 21:30. ההמראה הראשונה - טיסת חברת רויאל ג'ורדניאן לעמאן בשעה 22:30.

מסופי הגבול -  מסופי הנוסעים נהר הירדן, יצחק רבין וטאבה יפעלו בערב יום כיפור עד השעה 12:00, מסוף הנוסעים אלנבי יפעל עד השעה 11:00. במסוף טאבה תתחדש הפעילות בצאת כיפור בשעה 21:00.